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医院胃肠外科是自治区成立较早的以胃肠道肿瘤和腹外疝为特色的临床专业科室，是国家临床重点专科（普外科）、内蒙古自治区重点学科（普外科）、内蒙古自治区医药卫生领先学科（普外科）、全国优质护理示范病房、中华医学会外科学分会疝和腹壁外科学组腹膜前间隙疝修补技术培训中心、中国疝病专科联盟疝病治疗和研究中心，每年完成各型疝手术约800余台，年门诊量约30000人次，现开放床位83张，病房年收治患者3500余次，年手术量2000余例，其中胃肠道肿瘤约占1/2之多，全体医护人员以精准微创的手术操作、规范合理的综合治疗、丰富的病例管理经验和人性化的护理为患者治疗提供可靠保障。

医院胃肠外科将继续致力于科研与人才培养，鼓励、支持年轻医生外出进修、攻读学位和参加高水平学术会议，邀请优秀专家来院进行手术示教、学术交流，提高团队的整体水平。同时，为给更多患者提供医疗服务，胃肠外科也在开展减重代谢手术、胃食管反流与食管裂孔疝微创手术治疗，让患者在家门口享受到优质医疗资源及优质护理服务。